真空冻干机设备可以将冷干燥室和冷凝器集成在一个箱体中。两者之间有一层隔板，隔板的空腔内有阀块控制货架的进出。 可为产品冷冻提供更大的使用空间。无需在产品冷干燥室下建立单一部件安装空间，这种变型配置也较传统冻干设备配置节省了生产场地，降低了对安装施工的特殊要求。
在真空冻干机的蒸发器中进行空气与制冷剂低压蒸汽的对流热质交换。通过节流装置的低压制冷剂液体在蒸发器中发生相变成为低压制冷剂蒸气，在相变过程中吸收周围热量，从而使压缩空气冷却。
为了防止这种情况的发生，必须对真空冻干机中制冷剂的蒸发温度进行控制。简单有效的措施是在冷凝器和蒸发器之间增设热气旁通阀，热气旁通阀的测压管直接与蒸发压力相连。
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